주요기술주요기술
주요기술
2유닛-2주간
작성자 | 관리자 | 카테고리 | 삼성서울병원 |
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작성일 | 2023-09-27 | 조회수 | 97 |
2유닛-2주간
Multiplexing 기반 high throughput scRNA-seq 플랫폼 구축
개발자
박웅양 교수(삼성유전체연구소장), 삼성서울병원
기술설명
- 다양한 샘플을 pooling 하여 수만개의 단일세포를 동시에 분석하는 scRNA-seq multiplexing 분석 기술
- Genotype 정보를 바탕으로 샘플의 ID를 동정하는 기술
- 세포 당 50개의 single nucleotide polymorphism (SNPs) 으로 95% 이상의 정확도로 샘플의 ID 동정이 가능하며, genotype data를 활용하여 99% 이상의 정확도로 단일세포 동정 가능
- 다수의 연구과제를 통해 400여건의 데이터를 확보하였으며, high throughput scRNA-seq 플랫폼의 데이터 품질에 대한 검증 완료
기술특징
- 항체를 비롯한 additional tagging 없이 genotype 정보를 바탕으로 샘플의 ID를 동정하는 label-free 기술로써, label tagging에서 발생할 수 있는 오류가 없는 기술
- 최대 16종의 샘플을 동시에 러닝 가능한 기술로 분석 비용이 최대 25% 수준으로 감소
- 서로 다른 환자 유래의 많은 샘플을 pooling 하여 동시에 러닝을 진행함으로써 샘플간 batch effect를 줄일 수 있음
활용분야
대용량 단일세포 유전체분석