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2유닛-2주간

2유닛-2주간 : 작성자, 카테고리, 작성일, 조회수, 정보 제공
작성자 관리자 카테고리 삼성서울병원
작성일 2023-09-27 조회수 97

2유닛-2주간

Multiplexing 기반 high throughput scRNA-seq 플랫폼 구축

개발자

박웅양 교수(삼성유전체연구소장), 삼성서울병원

기술설명

  • 다양한 샘플을 pooling 하여 수만개의 단일세포를 동시에 분석하는 scRNA-seq multiplexing 분석 기술
  • Genotype 정보를 바탕으로 샘플의 ID를 동정하는 기술 
  • 세포 당 50개의 single nucleotide polymorphism (SNPs) 으로 95% 이상의 정확도로 샘플의 ID 동정이 가능하며, genotype data를 활용하여 99% 이상의 정확도로 단일세포 동정 가능
  • 다수의 연구과제를 통해 400여건의 데이터를 확보하였으며, high throughput scRNA-seq 플랫폼의 데이터 품질에 대한 검증 완료

기술특징

  • 항체를 비롯한 additional tagging 없이 genotype 정보를 바탕으로 샘플의 ID를 동정하는 label-free 기술로써, label tagging에서 발생할 수 있는 오류가 없는 기술 
  • 최대 16종의 샘플을 동시에 러닝 가능한 기술로 분석 비용이 최대 25% 수준으로 감소
  • 서로 다른 환자 유래의 많은 샘플을 pooling 하여 동시에 러닝을 진행함으로써 샘플간 batch effect를 줄일 수 있음

활용분야

대용량 단일세포 유전체분석